Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Mikrobiyal evrim, mahsul bilimi araştırmalarının hayati önem taşıyan bir alanıdır. Pek çok bakteri, mahsullerin patojenlerden korunması ve bitkilerin topraktan fosfor ve nitrojen gibi besinleri almasında yardımcı rol oynar. Bu bakteriler yalnızca mahsulün korunması ve iyileştirilmesi için düşük maliyetli bir çözüm sağlamakla kalmaz, aynı zamanda besin maddelerinin gübrelerden daha geniş bir çevreye sızmasını da azaltır. Bu nedenle bakteriler, evrimleri ve farklı türlerin özellikleri hakkında daha fazla bilgi edinmek tarımsal araştırmaların önemli bir parçasıdır.

VOYAGER aralıkları ayarlanabilir elektronik pipet ve VIAFLO hafif elektronik pipet, yüksek numune sayılarının analizini gerektiren çalışmalarda iş akışlarını düzene koymak ve tekrarlanabilir sonuçlar elde etmek için mükemmel laboratuvar arkadaşlarıdır. Reading Üniversitesi Biyolojik Çalışmalar Okulu'nda bakteriyel hareketliliğin (motilite) evrimi üzerine doktora çalışmalarını tamamlayan Dr. Astrid Altamirano-Junqueira, bu elektronik pipetlerin araştırmasına nasıl yardımcı olduğunu anlatıyor: “Doktora programımı, mikrobiyal evrimi araştırdığım Birleşik Krallık'ta 2019'da tamamladım. Pseudomonas fluorescens'de flagella ana düzenleyici gen olan FleQ'nun silinmesinin etkilerine bakarak mikrobiyal hareketliliğe odaklandım. Bakteriyel evrimde, genler yeni roller üstlenmek için sıklıkla kopyalanır ve mutasyona uğrar. 40'tan fazla farklı FleQ knockout P. fluorescens türü üzerinde derinlemesine gen ekspresyon çalışmaları yaptım ve flagella protein ekspresyonunu ve hareketliliğini eski haline getirmek için yabani tipte flagella ana regülatörü FleQ’nun bir parçası olduğu nitrojen yolunun yeniden bağlanmasının yaşandığı yeni bir tür belirledim. Daha sonra bu yeni "yüzücü" türün nitrojen yokluğundan nasıl etkilendiğini keşfetmeye çalıştım.”






















Hızlı Sonuçlar Sağlamak

“İlk görevim, işleme bağlı olarak kültür medyasında ortaya çıkması 1 ila 20 gün sürebilen FleQ knockout mutantlarını büyütmekti. P. fluorescens doğal olarak hareketli bir bakteri olduğundan, bir yüzeye yapışan veya süspansiyonda büyüyen organizmalar için tasarlanmış geleneksel inkübatör kurulumları uygun bir seçenek değildi. Aflagellat P. fluorescens'in yetersiz ajitasyonu, bakterilerin kuyucuğun dibine yerleşmesine ve kaynak kıtlığına yol açmasına neden oldu. Bu, zamanla, nitrojen açlığı olmasa bile büyümede bir azalmaya yol açar ve potansiyel olarak sonuçları çarpıtır. Bu nedenle, çok daha güçlü plaka sallaması sağlayan ve plakanın sabit ve oturmuş olmasına gerek kalmadan anında ölçüm yapabilen bir Bioscreen C MBR analizörü kullanmam gerekiyordu."


















"Bioscreen C'yi kullanmanın zorluğu, standart 96 kuyucuklu mikroplakalarla aynı kuyucuk aralığına sahip olmayan petek tasarımlı bir mikroplakayı kullanmaktır. İlk başta, her kuyucuğa ayrı ayrı pipetliyordum, ancak bu platformda bir seferde 200 adede kadar örneği inkübe edip analiz edebilirsiniz, bu da süreci inanılmaz derecede zaman alıcı hale getirir. Plakayı hazırlama ve aşılamayı ilk denediğimde neredeyse altı saat sürdü ve inanılmaz derecede yorucu olduğu için konsantrasyonum bozulursa hata yapma riskim yüksekti. Plaka tam olarak yüklenmeden bakterilerin büyümeye başlamaması için plakayı soğuk tutmak da zordu. Bu adımın zaman açısından kritik olması nedeniyle pipetleme için gerçekten daha verimli bir çözüme ihtiyacım vardı. Bu yüzden alternatif pipetleme seçeneklerini araştırmaya başladım ve INTEGRA’nın çok kanallı elektronik pipet serisini keşfettim. Bioscreen kullanım kılavuzu, çoklu numunelerin tüplerden plakalara veya farklı aralıklara sahip plakalar arasında kolay bir şekilde transfer edilebilmesini sağladığı için VOYAGER aralıkları ayarlanabilir elektronik pipeti cihazla kullanım için en verimli seçenek olarak önermektedir. VOYAGER ile bir plakanın tamamını 15 dakikadan daha kısa sürede yükleyebiliyorum ki bu inanılmaz."
























Farklı İş Akışları için Mükemmel Kombinasyon

"Bioscreen C ve VOYAGER'in bu kombinasyonu, çeşitli mutantların çoklu biyolojik kopyalarını büyütüp analiz etmeme, ardından nitrojen açlığının ve farklı nitrojen kaynaklarının bakteriyel hareketlilik üzerindeki etkilerini araştırmama izin verdi. Ayrıca iş akışımın diğer kısımlarında kullanmak için en az VOYAGER kadar esnek olan tek kanallı bir VIAFLO elektronik pipet edindim. Artık jel yükleme ve PCR kurulumu dahil çok çeşitli işler için her iki pipeti de kullanıyorum. Mekanik tek kanallı bir pipet kullanmaktan çok daha hızlı ve elektronik olduğu için başparmağı zorlamıyor. Geleneksel manuel pipetler, pipetleme için pistona çok daha fazla baskı gerektirir; bu da çok sayıda örneği işlerken veya çok adımlı bir protokol gerçekleştirirken elinize zarar verebilir. Elektronik pipetlerle birlikte sürekli gerilim yaralanması (RSI) riski azalıyor. Elektronik pipetler aynı zamanda hızlı ve doğru sonuçlar verdiği için zaman ve maliyet tasarrufu sağlayarak bir günde daha fazla numune işlememe olanak tanıyor. Her iki pipetin de iş akışına uyacak şekilde programlanabilmesi araştırmam için çok faydalıydı çünkü çok fazla tür vardı ve her biri için birden fazla kopya yapmam gerekiyordu."














Deneysel Yeteneklerin Geliştirilmesi

"VOYAGER ve VIAFLO pipetlerini kullanarak kazandığım zaman doktoramın son yılında daha fazla türün yanı sıra daha fazla kültür koşulu çalışabilmemi sağladı. Bu çalışma, türler hakkında olabildiğince fazla bilgi edinmeme izin verdi, ki bu, çok değişkenli analiz için hayati önemdeydi. İstatistikleri gerçekten analiz edebildim ve farklı mutantlar hakkında derinlemesine fikir edindim. Hatta genom dizilemesinden sonra yeni bir türün keşfedilmesine yol açan yeni bir amonyak taşıyıcısını bile tanımlayabildim - FleQS4. Bu çalışma şu anda yayınlanma aşamasında ve INTEGRA elektronik pipetleri sayesinde her tür için bu genin tüm PCR deney ve taramalarını sadece iki hafta içinde gerçekleştirebildim - VOYAGER için inanılmaz derecede müteşekkirim!"


 
Kaynak: https://www.integra-biosciences.com/global/en/stories/integras-electronic-pipettes-enable-vital-screening-microbial-evolution-research



 

Takip Et

Facebook
Twitter
LinkedIn
Instagram
YouTube

Paylaş

Facebook
Twitter
LinkedIn

Bunları da beğenebilirsiniz!

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Bilim insanları, tek kullanımlık maskelerin çevre için önemli ölçüde mikroplastik riski oluşturabileceği konusunda uyarıyor ve atıkların bertarafı için gelişmiş stratejilere acil bir ihtiyaç olduğunu vurguluyor.
  • 19 Ağu 2021

Devamı...

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır?

Yeni bir laboratuvar kurma sürecinde nükleik asit saflaştırma için neye ihtiyacınız olduğunu mu merak ediyorsunuz? Yoksa numunelerinizin aşağı akış uygulamanız için yeterince saf olmadığını mı fark ettiniz? Öyleyse doğru yerdesiniz. Bu makale, “Numunelerden Saf Nükleik Asitlere” serimizin dördüncü ve son bölümünü oluşturuyor. Nükleik asit ekstraksiyonu, bir PCR laboratuvarı kurulumu ve nükleik asit miktar tayini ve görselleştirme konularını ele aldıktan sonra, şimdi farklı saflaştırma yöntemlerinden bahsedeceğiz. Her tekni
  • 5 Ağu 2021

Devamı...

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik asitlerin örneklerden saflaştırılması moleküler biyoloji laboratuvarlarında yaygın bir iş akışıdır. Doğru kararları almanıza yardımcı olmak için bir laboratuvar kurarken ve ekipman satın alırken nelere dikkat etmeniz gerektiğini açıklayan dört bölümlük bir dizi hazırladık. Nükleik asit ekstraksiyon yöntemlerini ve bir PCR laboratuvarının nasıl kurulduğunu anlattıktan sonra, şimdi nükleik asitlerin konsantrasyonunu, verimini ve saflığını belirlemek için farklı yöntemlere göz atacağız.
  • 27 Tem 2021

Devamı...

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur?

Yeni bir laboratuvar kurmak heyecan verici olduğu kadar göz korkutucu bir süreç olabilir. Kendisine bir laboratuvar kurmak için yakın zamanda bu zorlukla yüzleşen INTEGRA, süreçten öğrendiklerini bu dört bölümlük dizide bir araya getirdi. Birinci bölümde nükleik asit ekstraksiyonu için neyin gerekli olduğu tartışıldıktan sonra, şimdi polimeraz zincir reaksiyonları (PCR) gerçekleştirirken nelerin dikkate alınması gerektiğine bakılacak.
  • 13 Tem 2021

Devamı...

Hiçbir Paylaşımı Kaçırmayın



İletişim Formu

Son paylaşımlar

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır?

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur?

Nükleik Asit Ekstraksiyonu İçin Gerekli Ekipmanlar Nelerdir

Nükleik Asit Ekstraksiyonu İçin Gerekli Ekipmanlar Nelerdir?

Protein Aktivitesinin Glikozilasyon Yoluyla Modifikasyonunun COVID19un Şiddetini Tahmin Etmek için Kullanılması

Protein Aktivitesinin Glikozilasyon Yoluyla Modifikasyonunun COVID-19’un Şiddetini Tahmin Etmek için Kullanılması

Biyofarmasötikler Nasıl Üretilir

Biyofarmasötikler Nasıl Üretilir?

Hücre Kültürü Çalışmalarında Saf Suyun Önemi Nedir

Hücre Kültürü Çalışmalarında Saf Suyun Önemi Nedir?

Doğal Bileşiklerin Saflaştırılması İçin Tavsiyeler

Doğal Bileşiklerin Saflaştırılması İçin Tavsiyeler

Antibiyotik Direncine Karşı Mücadelede Otomatik Pipetleme Robotlarının Kullanımı

Antibiyotik Direncine Karşı Mücadelede Otomatik Pipetleme Robotlarının Kullanımı

Covid19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

Covid-19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

ICPMS ve ICPOES analizlerinde saf suyun önemi nedir

ICP-MS ve ICP-OES analizlerinde saf suyun önemi nedir?

Flash kromatografi sistemlerinin bakımı nasıl yapılır

Flash kromatografi sistemlerinin bakımı nasıl yapılır?

Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Nanoemülsiyonlar CBD Yağını İçeceklere Karıştırmak

Nanoemülsiyonlar: CBD Yağını İçeceklere Karıştırmak

Laboratuvar için Farklı Saf Su Tipleri Hakkında Bilmeniz Gerekenler

Laboratuvar için Farklı Saf Su Tipleri Hakkında Bilmeniz Gerekenler

2021 için Kromatografi ve Rotary Evaporasyona Yönelik Kristal Küre Tahminleri

2021 için Kromatografi ve Rotary Evaporasyona Yönelik Kristal Küre Tahminleri

INTEGRA VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipetler Yardımıyla Yeni Nesil Bilim İnsanlarını Eğitmek

INTEGRA VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipetler Yardımıyla Yeni Nesil Bilim İnsanlarını Eğitmek

CBD Yağı Bazlı Nanoemülsiyonlar Üretmek için Kullanılan Yöntemler

CBD Yağı Bazlı Nanoemülsiyonlar Üretmek için Kullanılan Yöntemler

Hepatit B Enfeksiyonunu Önlemek için DNA Aşılarının Araştırılması

Hepatit B Enfeksiyonunu Önlemek için DNA Aşılarının Araştırılması

Gelin bu olağandışı yılı sıra dışı bir blog yazısıyla noktalayalım

Gelin bu olağandışı yılı sıra dışı bir blog yazısıyla noktalayalım!

Doğru Rezervuar ile Değerli Reaktiflerinizi Koruyun ve Tasarruf Edin

Doğru Rezervuar ile Değerli Reaktiflerinizi Koruyun ve Tasarruf Edin

Tanı Testleri için Kaliteli Enzimler Nasıl Oluşturulur

Tanı Testleri için Kaliteli Enzimler Nasıl Oluşturulur?

Papatya Çayındaki Ağır Metallerin Tespit Edilmesi

Papatya Çayındaki Ağır Metallerin Tespit Edilmesi

INTEGRA çözümleri tanı test ve araştırmalarını nasıl hızlandırıyor

INTEGRA çözümleri tanı test ve araştırmalarını nasıl hızlandırıyor?

Kararlı ve steril Propofol nasıl üretilir

Kararlı ve steril Propofol nasıl üretilir?

Kromatografi kolonları kuru doldurma dry packing yöntemiyle üç adımda nasıl doldurulur

Kromatografi kolonları kuru doldurma (dry packing) yöntemiyle üç adımda nasıl doldurulur?

Gıda Ambalajları için Yeşil Plastiklerin Geliştirilmesi

Gıda Ambalajları için Yeşil Plastiklerin Geliştirilmesi

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet Basel Üniversitesinde immünoloji araştırmalarını nasıl hızlandırıyor

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet Basel Üniversitesi'nde immünoloji araştırmalarını nasıl hızlandırıyor?

Hücre parçalanması nedir ve bunun için hangi metotlar kullanılır

Hücre parçalanması nedir ve bunun için hangi metotlar kullanılır?

RFID teknolojisi kromatografi analizlerine nasıl yardımcı olur

RFID teknolojisi kromatografi analizlerine nasıl yardımcı olur?

Biyomimikri ArGeye Giden Doğal Yol

Biyomimikri: Ar-Ge'ye Giden Doğal Yol

Elektronik Pipet Kullanmak için 5 Neden

Elektronik Pipet Kullanmak için 5 Neden

Aşı Geliştirme Çalışmalarında Microfluidizer Teknolojisi Nasıl Kullanılır

Aşı Geliştirme Çalışmalarında Microfluidizer Teknolojisi Nasıl Kullanılır?

Kromatografi analizlerinde pik bölünmesi ve pik omuzlanması nasıl önlenir

Kromatografi analizlerinde pik bölünmesi ve pik omuzlanması nasıl önlenir?

Virüslerin Saptanması ve Karakterizasyonunda HPLCnin Rolü Nedir

Virüslerin Saptanması ve Karakterizasyonunda HPLC'nin Rolü Nedir?

Kozmetik ürünlerin etiketlerindeki maddeler nasıl elde edilir

Kozmetik ürünlerin etiketlerindeki maddeler nasıl elde edilir?

Aşı Taşıyıcı Sistemlerin Tasarımında Lipid Nanopartiküllerin Kullanımı

Aşı Taşıyıcı Sistemlerin Tasarımında Lipid Nanopartiküllerin Kullanımı

Microfluidizer İşlemcileri Aşı Üretimine Destek İçin Nasıl Kullanılır

Microfluidizer İşlemcileri Aşı Üretimine Destek İçin Nasıl Kullanılır?

COVID19 için PCR işlemlerinizi hızlandırın

COVID-19 için PCR işlemlerinizi hızlandırın

Kahvenizin içinde ne var

Kahvenizin içinde ne var?

Etiketler

Elektronik Pipet   Mikrobiyal Evrim   Bakteri   Tarama   

PCR   Integra   

Makaledeki ürünler

VIAFLO II 8, 12, 16 Kanallı Elektronik Pipetler

VIAFLO II 8, 12, 16 Kanallı Elektronik Pipetler

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet