Covid19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

Covid-19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

Dünyanın dikkati, yüksek hızda uygulanabilir Covid-19 aşıları geliştirmeye ve dağıtmaya odaklansa da hızlı ve doğru tanı testlerinin virüsün yayılmasını durdurmada öncelik olmaya devam ettiğini göz ardı etmemeliyiz. Pandeminin ilk günlerinde, yetersiz ulaşılabilirlik, yanlış sonuçlar ve sonuç almanın uzun sürmesi, COVID-19 testine yönelik yaygın şikayetlerdi. Test ve sonuçlar arasındaki uzun bekleme süreleri genellikle haftalar aldı ve yanlış negatif test sonuçları, test zamanına bağlı olarak yaklaşık %20 oranında rapor edildi. Bu virüsün tanımlanması ve test edilmesi zorlayıcı olmaktadır, ancak iyileştirilmiş geri dönüş süreleri ile doğru tanı testleri Covid-19'un yayılmasını durdurmak için etkili yollardır.

COVID-19 Tanı Testlerine Genel Bir Bakış

Covid-19 testi gibi çoğu moleküler tanı testi, saptama ve tanı için kullanılan RNA ve DNA dizilerinin çoğaltılmasını gerektiren amplifikasyon sürecine dayanır. Amplifikasyon yoluyla, çok sayıda DNA replikasyonu toplanır, tespit edilir ve ölçülür. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR), tek bir DNA zincirinden sınırsız kopya oluşturulabilmesi nedeniyle tanısal testlerin altın standardı olarak kabul edilir. Bununla birlikte son dönemde, alternatif bir Covid-19 tanı testi yönteminin hem son derece hassas hem de son derece spesifik olduğu kanıtlanmıştır. Bu alternatif Covid-19 tanı testi düzenli aralıklarla bölünmüş palindromik tekrar kümeleri (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-CRISPR) teknolojisine dayanmaktadır.

CRISPR Teknolojisi

CRISPR, tanı için daha spesifik ve hedeflenmiş bir yaklaşım sağlayan bir gen hedefleme ve düzenleme teknolojisidir. CRISPR yöntemi, Cas12 veya Cas13 enzimleriyle ilişkilendirildiğinde belirli COVID-19 nükleik asit dizilerinin saptanmasına izin verir. Daha sonra, hedef tanıma üzerine aktive olan haberci moleküllerin yardımıyla görsel bir sinyal üretilebilir.

Döngü aracılı izotermal amplifikasyon (Loop-mediated Isothermal Amplification-LAMP) yöntemiyle birlikte CRISPR-Cas tespit yönteminin hızlı ve güvenilir bir tanı testi olduğu bulunmuştur. PCR'den farklı olarak, LAMP bir ısı döngüsü kullanmaz ve bu nedenle sonuçlar daha hızlıdır ve daha az ekipman gerektirir. LAMP'in izotermal yapısı ve hedef dışı dizilerin replikasyonunun oluşturduğu önceki sınırlamaları, yanlış pozitif sonuçlara neden olmaktaydı. CRISPR teknolojisi artık bu sorunların çözülmesine yardımcı olarak hızlı ve güvenilir sonuçlar elde edilmesini sağlamaktadır.

CRISPR tabanlı test şunları göstermiştir:
  • Test sonuçlarına daha hızlı ulaşılır.
  • Numuneyi analiz etmek için test laboratuvarında daha az cihaz gerekir.
  • Hem pozitif hem de negatif test sonuçları yüksek doğruluk gösterir.
  • Sonuçların kolay anlaşılmasıyla potansiyel olarak reçetesiz kullanılabilir.

CRISPR Tanı Testinde Microfluidics’in Rolü Nedir?

PCR'deki Taq polimeraz gibi, Cas proteinleri de CRISPR tabanlı tanı yöntemi için temel unsurlardır. Viral DNA veya RNA üzerindeki belirli bölgeleri hedefler ve daha sonra test sonuçlarını yorumlamak için analiz edilen bir sinyal gönderirler. Bu enzimler genellikle E.Coli gibi bakteri hücrelerinde tasarlanır ve eksprese edilir. Bu enzimlerin hücre parçalanması yoluyla ekstraksiyonu, tanı amaçlı COVID-19 testleri geliştirmede ve test kitlerinin seri üretiminde kilit rol oynar.

Microfluidizer® işlemcileri hem PCR hem de CRISPR tabanlı tanı metotları için bu kritik enzimlerin üretilmesinde etkili bir şekilde kullanılabilir. Hücre parçalanmasındaki temel zorluk, hücre içi enzimlerin hasar görmeden salınabilmesi için hücreleri güvenli bir şekilde parçalamak ve aynı zamanda bütün üretim partileri için stabil ve tekrarlanabilir sonuçları garanti edebilmektir.

Microfluidizer® teknolojisi, kontrollü kesme kuvveti (shear force) ile enzim geri kazanımında yüksek verim elde ederek yüksek kaliteli hücre parçalanması sonuçları verir. Her parti tam olarak aynı işlemden geçer, bu da hücre parçalanmasında anahtar unsurlar olan daha uniform sonuçlar ve daha kolay aşağı akış filtrasyonu sağlar.








Microfluidizer® işlemciler, diğer yüksek basınçlı homojenizatörlere (HPH) kıyasla daha avantajlıdır çünkü:
  • Hızlı sonuç verir ve numuneler alternatif yöntemlere göre daha kısa sürede işlenir.
  • Temizlemesi kolaydır ve çok az bakım gerektirir.
  • Soğutma sistemi, hassas biyolojik hücre içeriklerine zarar vermeyecek şekilde etkilidir.
  • Hücre proteininin atıklardan genel olarak daha iyi ayrılmasını sağlar.
  • Daha kolay filtrasyon için daha düşük viskozite sağlar.

Microfluidizer® teknolojisi devrim niteliğindeki çok kanallı Etkileşim Odası™ sayesinde hacimden bağımsız olarak sonuçların her seferinde tek tip olmasını sağlayan ölçek büyütme olanaklarına sahiptir. Bu nedenle, sonuçlar laboratuvar ölçeğinden pilot ve üretim ölçeğine kadar aynıdır.
 











COVID-19 ile mücadelede, Microfluidics benzersiz sonuçlar sunar ve şirketlerin en karmaşık sorunlarını çözme konusunda yılların uzmanlığından yararlanır. Microfluidics, araştırmadan üretime kadar kaliteli sonuçlar elde etmeye yardımcı olacak bilgiye sahiptir.
 


Kaynak: https://www.microfluidics-mpt.com/blog/covid-19-diagnostic-testing-developments-and-the-role-of-cell-rupture



 

Takip Et

Facebook
Twitter
LinkedIn
Instagram
YouTube

Paylaş

Facebook
Twitter
LinkedIn

Bunları da beğenebilirsiniz!

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Bilim insanları, tek kullanımlık maskelerin çevre için önemli ölçüde mikroplastik riski oluşturabileceği konusunda uyarıyor ve atıkların bertarafı için gelişmiş stratejilere acil bir ihtiyaç olduğunu vurguluyor.
  • 19 Ağu 2021

Devamı...

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır?

Yeni bir laboratuvar kurma sürecinde nükleik asit saflaştırma için neye ihtiyacınız olduğunu mu merak ediyorsunuz? Yoksa numunelerinizin aşağı akış uygulamanız için yeterince saf olmadığını mı fark ettiniz? Öyleyse doğru yerdesiniz. Bu makale, “Numunelerden Saf Nükleik Asitlere” serimizin dördüncü ve son bölümünü oluşturuyor. Nükleik asit ekstraksiyonu, bir PCR laboratuvarı kurulumu ve nükleik asit miktar tayini ve görselleştirme konularını ele aldıktan sonra, şimdi farklı saflaştırma yöntemlerinden bahsedeceğiz. Her tekni
  • 5 Ağu 2021

Devamı...

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik asitlerin örneklerden saflaştırılması moleküler biyoloji laboratuvarlarında yaygın bir iş akışıdır. Doğru kararları almanıza yardımcı olmak için bir laboratuvar kurarken ve ekipman satın alırken nelere dikkat etmeniz gerektiğini açıklayan dört bölümlük bir dizi hazırladık. Nükleik asit ekstraksiyon yöntemlerini ve bir PCR laboratuvarının nasıl kurulduğunu anlattıktan sonra, şimdi nükleik asitlerin konsantrasyonunu, verimini ve saflığını belirlemek için farklı yöntemlere göz atacağız.
  • 27 Tem 2021

Devamı...

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur?

Yeni bir laboratuvar kurmak heyecan verici olduğu kadar göz korkutucu bir süreç olabilir. Kendisine bir laboratuvar kurmak için yakın zamanda bu zorlukla yüzleşen INTEGRA, süreçten öğrendiklerini bu dört bölümlük dizide bir araya getirdi. Birinci bölümde nükleik asit ekstraksiyonu için neyin gerekli olduğu tartışıldıktan sonra, şimdi polimeraz zincir reaksiyonları (PCR) gerçekleştirirken nelerin dikkate alınması gerektiğine bakılacak.
  • 13 Tem 2021

Devamı...

Hiçbir Paylaşımı Kaçırmayın



İletişim Formu

Son paylaşımlar

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Kullanılmış Maskeler Mikroplastik Riski Oluşturuyor

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır

Nükleik Asitler Nasıl Saflaştırılır?

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Nükleik Asitlerin Saflık ve Konsantrasyonunun Belirlenmesi

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur

Bir PCR Laboratuvarı Nasıl Kurulur?

Nükleik Asit Ekstraksiyonu İçin Gerekli Ekipmanlar Nelerdir

Nükleik Asit Ekstraksiyonu İçin Gerekli Ekipmanlar Nelerdir?

Protein Aktivitesinin Glikozilasyon Yoluyla Modifikasyonunun COVID19un Şiddetini Tahmin Etmek için Kullanılması

Protein Aktivitesinin Glikozilasyon Yoluyla Modifikasyonunun COVID-19’un Şiddetini Tahmin Etmek için Kullanılması

Biyofarmasötikler Nasıl Üretilir

Biyofarmasötikler Nasıl Üretilir?

Hücre Kültürü Çalışmalarında Saf Suyun Önemi Nedir

Hücre Kültürü Çalışmalarında Saf Suyun Önemi Nedir?

Doğal Bileşiklerin Saflaştırılması İçin Tavsiyeler

Doğal Bileşiklerin Saflaştırılması İçin Tavsiyeler

Antibiyotik Direncine Karşı Mücadelede Otomatik Pipetleme Robotlarının Kullanımı

Antibiyotik Direncine Karşı Mücadelede Otomatik Pipetleme Robotlarının Kullanımı

Covid19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

Covid-19 Tanı Testlerinde Hücre Parçalanmasının Rolü

ICPMS ve ICPOES analizlerinde saf suyun önemi nedir

ICP-MS ve ICP-OES analizlerinde saf suyun önemi nedir?

Flash kromatografi sistemlerinin bakımı nasıl yapılır

Flash kromatografi sistemlerinin bakımı nasıl yapılır?

Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Elektronik Pipetlerin Mikrobiyal Evrim Araştırmalarında Tarama için Kullanılması

Nanoemülsiyonlar CBD Yağını İçeceklere Karıştırmak

Nanoemülsiyonlar: CBD Yağını İçeceklere Karıştırmak

Laboratuvar için Farklı Saf Su Tipleri Hakkında Bilmeniz Gerekenler

Laboratuvar için Farklı Saf Su Tipleri Hakkında Bilmeniz Gerekenler

2021 için Kromatografi ve Rotary Evaporasyona Yönelik Kristal Küre Tahminleri

2021 için Kromatografi ve Rotary Evaporasyona Yönelik Kristal Küre Tahminleri

INTEGRA VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipetler Yardımıyla Yeni Nesil Bilim İnsanlarını Eğitmek

INTEGRA VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipetler Yardımıyla Yeni Nesil Bilim İnsanlarını Eğitmek

CBD Yağı Bazlı Nanoemülsiyonlar Üretmek için Kullanılan Yöntemler

CBD Yağı Bazlı Nanoemülsiyonlar Üretmek için Kullanılan Yöntemler

Hepatit B Enfeksiyonunu Önlemek için DNA Aşılarının Araştırılması

Hepatit B Enfeksiyonunu Önlemek için DNA Aşılarının Araştırılması

Gelin bu olağandışı yılı sıra dışı bir blog yazısıyla noktalayalım

Gelin bu olağandışı yılı sıra dışı bir blog yazısıyla noktalayalım!

Doğru Rezervuar ile Değerli Reaktiflerinizi Koruyun ve Tasarruf Edin

Doğru Rezervuar ile Değerli Reaktiflerinizi Koruyun ve Tasarruf Edin

Tanı Testleri için Kaliteli Enzimler Nasıl Oluşturulur

Tanı Testleri için Kaliteli Enzimler Nasıl Oluşturulur?

Papatya Çayındaki Ağır Metallerin Tespit Edilmesi

Papatya Çayındaki Ağır Metallerin Tespit Edilmesi

INTEGRA çözümleri tanı test ve araştırmalarını nasıl hızlandırıyor

INTEGRA çözümleri tanı test ve araştırmalarını nasıl hızlandırıyor?

Kararlı ve steril Propofol nasıl üretilir

Kararlı ve steril Propofol nasıl üretilir?

Kromatografi kolonları kuru doldurma dry packing yöntemiyle üç adımda nasıl doldurulur

Kromatografi kolonları kuru doldurma (dry packing) yöntemiyle üç adımda nasıl doldurulur?

Gıda Ambalajları için Yeşil Plastiklerin Geliştirilmesi

Gıda Ambalajları için Yeşil Plastiklerin Geliştirilmesi

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet Basel Üniversitesinde immünoloji araştırmalarını nasıl hızlandırıyor

VOYAGER Aralıkları Ayarlanabilir Elektronik Pipet Basel Üniversitesi'nde immünoloji araştırmalarını nasıl hızlandırıyor?

Hücre parçalanması nedir ve bunun için hangi metotlar kullanılır

Hücre parçalanması nedir ve bunun için hangi metotlar kullanılır?

RFID teknolojisi kromatografi analizlerine nasıl yardımcı olur

RFID teknolojisi kromatografi analizlerine nasıl yardımcı olur?

Biyomimikri ArGeye Giden Doğal Yol

Biyomimikri: Ar-Ge'ye Giden Doğal Yol

Elektronik Pipet Kullanmak için 5 Neden

Elektronik Pipet Kullanmak için 5 Neden

Aşı Geliştirme Çalışmalarında Microfluidizer Teknolojisi Nasıl Kullanılır

Aşı Geliştirme Çalışmalarında Microfluidizer Teknolojisi Nasıl Kullanılır?

Kromatografi analizlerinde pik bölünmesi ve pik omuzlanması nasıl önlenir

Kromatografi analizlerinde pik bölünmesi ve pik omuzlanması nasıl önlenir?

Virüslerin Saptanması ve Karakterizasyonunda HPLCnin Rolü Nedir

Virüslerin Saptanması ve Karakterizasyonunda HPLC'nin Rolü Nedir?

Kozmetik ürünlerin etiketlerindeki maddeler nasıl elde edilir

Kozmetik ürünlerin etiketlerindeki maddeler nasıl elde edilir?

Aşı Taşıyıcı Sistemlerin Tasarımında Lipid Nanopartiküllerin Kullanımı

Aşı Taşıyıcı Sistemlerin Tasarımında Lipid Nanopartiküllerin Kullanımı

Microfluidizer İşlemcileri Aşı Üretimine Destek İçin Nasıl Kullanılır

Microfluidizer İşlemcileri Aşı Üretimine Destek İçin Nasıl Kullanılır?

COVID19 için PCR işlemlerinizi hızlandırın

COVID-19 için PCR işlemlerinizi hızlandırın

Kahvenizin içinde ne var

Kahvenizin içinde ne var?

Etiketler

Tanı Testi   Enzim   Covid-19   Amplifikasyon   PCR   

CRISPR   LAMP   Hücre Parçalanması   Microfluidizer   

Yüksek Basınçlı Homojenizatör   Microfluidics   

Makaledeki ürünler

LM 20 Küçük Numuneler için Elektrikli Laboratuar Cihazı

LM 20 Küçük Numuneler için Elektrikli Laboratuar Cihazı

M815 Pilot ve Küçük Üretim Ölçekli  Yüksek Basınçlı Homojenizatör

M815 Pilot ve Küçük Üretim Ölçekli Yüksek Basınçlı Homojenizatör